启动 Net Time Server & Client 后，在系统托盘区（时钟附近） 将显示其图标。 在不需要更多的系统资源的情况下可提供以下功能：
右键单击托盘区图标将显示托盘区菜单，以便在 Net Time Server & Client 的“主窗口”已隐藏的情况下操作它。全部菜单项需要使用鼠标左键单击来执行它。
该菜单项重新显示 Net Time Server & Client 的“主窗口”和其它已经打开的窗口，就像使用鼠标左键双击“托盘区图标”一样。
该菜单的作用与点击“主窗口”中的“隐藏”按钮相同。它隐藏 Net Time Server & Client 的所有窗口。此外，也可以通过使用鼠标左键双击“托盘区图标”来隐藏这些窗口。参见“主窗口”中的“隐藏”按钮。
该菜单的作用与点击“主窗口”内“客户端 - 单播／任播”页“手动同步”框中的“同步”按钮相同。它使的 Net Time Server & Client 单播／任播客户端启动同步过程，将计算机时钟与“主窗口”内“客户端 - 单播／任播”页“源时间服务器队列”中的一个时间服务器进行同步。参见“客户端 - 单播／任播”页“手动同步”框中的“同步”按钮。
该菜单的作用与点击“主窗口”内“客户端 - 单播／任播”页“手动同步”框中的“取消”按钮相同。它使的 Net Time Server & Client 单播／任播客户端停止正在进行的同步过程，包括手动启动的同步过程和自动启动的同步过程。参见“主窗口”内“客户端 - 单播／任播”页“手动同步”框中的“取消”按钮。
该菜单的作用与点击“主窗口”中的“帮助”按钮相同。它打开该帮助窗口。参见“主窗口”中的“帮助”按钮。
启动后首次使用该菜单将打开帮助“目录”，其它情况下将打开“页面工作区”中当前页面的帮助信息。
该菜单的作用与点击“主窗口”中的“退出”按钮相同。它立即关闭 Net Time Server & Client 程序，删除系统托盘区的图标，并释放占用的内存。参见“主窗口”中的“退出”按钮。
作为一种尝试，为了帮助普通用户理解 Net Time Server & Client 正在进行的工作，当发生日志事件以后，如果在“主窗口”的“日志 - 设置”页勾选了该日志项的“显示气球提示”项，那么“托盘区图标”处将会弹出一个气球提示框以显示该日志事件的详细信息。点击该气球提示框将关闭它。此外，如果在“主窗口”的“选项”页勾选了“点击气球提示显示详细信息”项，则点击该气球提示框也将会打开“托盘区气球提示详细信息”窗口以进一步显示该日志事件的详细信息。